Il patrimonio, cartaceo e digitale, è composto da circa 25.000 documenti in varie lingue e tipologie (monografie, letteratura grigia, spogli di articoli, audiovisivi, ecc.) e da circa 200 periodici, nazionali e internazionali; esso aggrega due collezioni:

• la collezione dell'Istituto degli Innocenti: specializzata sui temi psicologici, pedagogici, sociali, giuridici e statistici relativi all’infanzia e all’adolescenza, con particolare attenzione all'Italia, comprende materiale bibliografico, audiovisivisi, norme e statistiche. Fanno parte della collezione anche i fondi speciali Alfredo Carlo Moro, Angelo Saporiti e Valerio Ducci e una sezione storica sull'Istituto degli Innocenti
• la collezione dell'Unicef Innocenti Office of Research: specializzata nella documentazione relativa alla Convenzione delle Nazioni Unite sui diritti dei bambini; particolarmente sviluppate sono anche la sezione giuridica (diritti umani, trattati internazionali, giustizia giovanile) e quella economica (economia dello sviluppo, condizioni socio-economiche dei paesi in transizione e condizione dei bambini nei paesi industrializzati). La maggior parte dei documenti sono in inglese e in francese.